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放大字体  缩小字体 发布日期:2019-06-25 09:31  浏览次数:2
摘 要:甘薯绿矮化病毒(spcsv;crinavirus属,closteroviridae)是甘薯的重要经济病原。本研究采用miseq-illumina测序法对甘薯嫁接木薯
 甘薯绿矮化病毒(spcsv;crinavirus属,closteroviridae)是甘薯的重要经济病原。本研究采用miseq-illumina测序法对甘薯嫁接木薯的两个RNA片段(分离株spcsv-unb-01)的核苷酸序列进行了测定。对spcsv-unb-01和其他spcsv序列的基因组结构进行了比较分析,结果表明,RNA1缺乏p22、p5.1和p5.2。在RNA2中不存在,表明一个独特的基因组模式。SPcsv-UNB-01包含较长的p6和p5区域,与同源序列几乎没有相似性。序列比较没有显示这些开放读帧(ORF)中任何以前识别的功能域。未检测到重组或重排事件。系统发育分析表明,根据spcsv-unb-01和秘鲁分离株m2-47之间的遗传距离,可以将spcsv分离到南美。巴西东北部(Pernambuco州)的样本在使用主要外壳蛋白(CP)基因的特异性引物进行测试时,SPcsv阳性。这是巴西的第一个spcsv-unb-01全长基因组序列。
 
 
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