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放大字体  缩小字体 发布日期:2019-11-09 14:20  浏览次数:0
摘 要:无论是哺乳动物、鸟类、爬行动物还是两栖动物,植物的基因组比所有动物都要大,也更复杂。鱼是这条规则的例外。人类DNA由大约32
 无论是哺乳动物、鸟类、爬行动物还是两栖动物,植物的基因组比所有动物都要大,也更复杂。鱼是这条规则的例外。
 
人类DNA由大约32亿个碱基对组成,分布在23对染色体上,共有46条染色体。然而,小麦(Triticum aestivum)的基因组包含170亿对碱基,分成21对染色体(总共42对)。甘蔗(Saccharum spp.)的基因组包含100-130条染色体上的100亿对碱基。
 
今天种植的甘蔗是由两个品种杂交而成的(杂交甘蔗),即3000年前在印度驯化的原始甘蔗S.officinarum和S.spontaneum。
 
“甘蔗基因组已经成为一个巨大的物种。用目前的基因组学方法来研究它是非常困难的。破译它需要巨大的计算能力。即使是最先进的计算机在处理方面也很困难,而且价格昂贵。总之,这是对生物信息学的挑战,”巴西圣保罗州坎皮纳斯大学生物研究所(IB-UNICAMP)基因组学和生物能源实验室(LGE)生物信息学协调员Marcelo Falsarella Carazzolle说。
 
“多年来,世界各地的实验室都试图绘制甘蔗基因组图,但都失败了。第一次成功的尝试是几个月前由几个国家的研究人员组成的财团完成的,包括巴西。
 
该部署的战略涉及大规模计算和对整个基因组(即100亿个碱基对)进行测序的大量投资。
 
在发表在《DNA研究》杂志上的一篇文章中,Carazzolle和他的同事提出了一种不同的策略,这种策略成本更低、耗时也更少。这项技术旨在绘制多倍体植物基因组的特定部分。
 
支持这一创新的一些研究是为卡丽娜·亚纳古伊·德·阿尔梅达的博士论文和朱利安娜·何塞的博士后项目进行的。两人都是IB-UNICAMP的生物学家,由Gonçalo Amarante Guimarães Pereira教授监管。巴西国家科学技术发展委员会(CNPq)也提供了资金。
 
 
 
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